Анализ на биомаркеры опухоли

Биомаркером называют биологический признак, характеристику, которая применяется в качестве идентификатора состояния организма. Биологические маркеры используют для оценки текущих физиологических процессов в организме, для прогнозирования индивидуальных рисков заболевания, для выявления болезни, оценки эффективности её лечения и исхода, разработки новых лекарств, оценки негативных факторов внешней среды.

Виды онкологических биомаркеров


Диагностические биомаркеры служат для ранней диагностики и выявления рака. Прогностические позволяют оценить прогноз развития заболевания, предиктивные дают возможность предсказать ответ на терапию.

Основными факторами в выборе тактики лечения являются стандартные, общеизвестные прогностические и предиктивные характеристики опухолевого процесса. Обнаружение новых онкологических биомаркеров предоставило дополнительные возможности для персонализированной медицины. Наибольшую известность получили экспрессионные прогностические и предиктивные характеристики опухолевого процесса.

Методом оценки статуса тех или иных молекул является иммуногистохимический тест. В последние десятилетия получили популярность экспрессионные тесты, основанные на детекции специфических молекул РНК. Так, предиктивные экспрессионные онкологические биомаркеры (в т. ч. HER2, DPD, TP, BRCA1 и др.) можно оценивать как с помощью ИГХ, так и посредством ПЦР-анализа генной экспрессии.

Разновидностью молекулярно-генетических анализов являются мутационные тесты. Изучение генных мутаций может помочь оценить чувствительность опухоли к специфическим препаратам, а также определить резистентность новообразования к терапии. Например, мутации в гене EGFR гарантируют ответ карциномы легкого на лечение препаратами гефитиниб, эрлотиниб, афатинибом. А мутации генов KRAS, NRAS и BRAF заставляют отказаться от цетуксимаба или панитумумаба при терапии рака прямой кишки.

Таким образом, онкологические биомаркеры являются основой для персонализированной медицины. С их помощью можно подбирать оптимальную таргетную терапию.

Онкологические биомаркеры при различных заболеваниях

Для диагностики рака молочной железы используются следующие онкомаркеры:

  • MammaPrint;
  • HER2/neu;
  • BRCA1/2.

Онкологические биомаркеры рака легкого:

  • EGFR;
  • ALK;
  • ROS1;
  • RET и др.

В список онкологических биомаркеров колоректального рака входят:

  • KRAS;
  • NRAS;
  • EGFR;
  • BRAF.

О рисках меланомы говорят такие онкологические биомаркеры, как BRAF, KIT.

Биомаркеры ранней диагностики рака

До недавнего времени основным методом раннего обнаружения рака простаты был анализ на простатический специфический антиген (ПСА). Он имеет ряд недостатков, главный из которых состоит в том, что это не онкологический биомаркер, а органоспецифический маркер. Это привело к гипердиагностике рака простаты. Тест на PCA3 обладает более высокой специфичностью и позволяет снизить количество нецелесообразных биопсий.

Жидкостная биопсия для определения онкологических биомаркеров

Новая технология позволяет проводить детекцию онкомаркеров в крови или других биологических жидкостях. Жидкостная биопсия используется для ранней диагностики рака, контроля эффективности противоопухолевой терапии, мониторинга метастазирования и рецидивов.

  • в 56 генах;
  • 10 генах, ассоциированных с раком легкого;
  • 4 генах, ассоциированных меланомой, раком толстой кишки.

  • Как проводится исследование опухоли на чувствительность к химиопрепаратам?
  • Какие преимущества предоставляет этот анализ?
  • Как я узнаю, что это подходит мне?
  • Какие методы используются для проведения анализа?
  • Что входит в отчёт по данным анализа?
  • Какой образец нужен, чтобы провести это исследование?
  • Где проводится это исследование?
  • Когда я смогу получить результаты исследования?

Научные открытия и технологические достижения сделали возможным исследовать опухоль на молекулярном уровне. С помощью тщательного анализа генетической информации и белков конкретной опухоли может быть сформирован так называемый молекулярный отпечаток вашей опухоли.

Узнайте, как последние революционные открытия в генетике и молекулярной биологии позволяют врачам получить данные для персонализированного подхода к лечению именно вашего рака. В результате исследования опухоли мы узнаем о наиболее эффективных лекарствах в каждом конкретном случае.

Как проводится исследование опухоли на чувствительность к химиопрепаратам?

Проводимое исследование различает клеточные компоненты, играющие наиболее важную роль в распространении рака. Их иногда еще называют биомаркеры. Биомаркеры составляют тот самый молекулярный отпечаток, специфический для данного пациента. Этот отпечаток в последующем сравнивается с данными доказательной медицины из современной медицинской литературы.

Данные предоставляются в виде отчета. Этот отчет поможет вашему врачу найти ту самую терапию, дающую максимальный шанс благоприятного исхода заболевания и максимально эффективную программу борьбы против опухоли.

Отчет также содержит информацию о препаратах, которых следует избегать. С помощью этой информации ваш врач примет решение о том протоколе лечения, который подходит именно вам, исходя из данных о вашей опухоли и общего состояния вашего здоровья.

Вы можете получить наиболее эффективную терапию, чтобы атаковать рак и минимизировать воздействие на здоровые клетки.

Для согласования порядка проведения анализа на чувствительность опухолей к химиопрепаратам звоните по телефону +7 (495) 151-14-53+7 (861) 200-29-568 800 100 14 98 или направьте запрос по электронной почте hospital@euroonco.ru


Какие преимущества предоставляет этот анализ?

Данные анализа на чувствительность к химиопрепаратам помогут вашему врачу сделать выбор между уже существующими протоколами лечения заболевания. Более того, они могут помочь выбрать ту терапию, которая обычно не применяется при данном виде заболевания, но может иметь положительный эффект, исходя из конкретного уникального отпечатка вашей опухоли. Этот отпечаток сопоставляется с самыми последними и лучшими данными современной медицинской литературы, чтобы определить все возможные варианты лечения, которые потенциально могут помочь.

Некоторая информация в данных вашего профиля может указать на ваше возможное участие в клиническом исследовании новых препаратов лечения того или иного заболевания.

Как я узнаю, что это подходит мне?

Проведение анализа возможно для любой плотной опухоли, например:

Чаще всего этот анализ используется у пациентов, которым стандартная терапия уже проводилась, но без должной эффективности. Также это подходит людям с метастатическим раком или пациентам с редкими или агрессивными опухолями.

Даже если вы уже проходите терапию, вам все равно может помочь этот анализ. Ваш онколог способен оценить предоставленную в отчете информацию, чтобы выбрать максимально подходящую вам терапию.

Какие методы используются для проведения анализа?

Анализ опухоли включает в себя разные техники определения биомаркеров вашей опухоли. Команда ученых использует те же самые технологии, которыми пользуются ученые с мировыми именами, публикующиеся в научных изданиях. Все данные, предоставляемые отчетом, основаны на принципах доказательной медицины. Технологии, которые мы используем, включают в себя

  • иммуногистохимию,
  • флуоресцентную гибридизацию in situ,
  • хромогенную гибридизацию in situ
  • секвенирование (анализ последовательности ДНК) последнего поколения.


Что входит в отчёт по данным анализа?

В отчёт включены результаты вашего анализа, описания препаратов, которые могут или не могут потенциально вам помочь. Помимо этого, отчет содержит сопроводительные данные из клинических исследований, на основе которых он составлялся. В приложении к отчету предоставляется краткое изложение в понятной для пациента форме. Отчёт направляется непосредственно вашему врачу.

Какой образец нужен, чтобы провести это исследование?

Исследование проводится на ткани, которую получают в результате хирургического удаления опухоли или из образца, взятого во время биопсии. Так как биомаркеры вашей опухоли могут изменяться с течением времени, лучше предоставить самый последний образец для анализа. Если же недавнего образца нет, мы все равно можем провести это исследование. Если у вас нет на руках такого образца, то скорее всего там, где вы проходили лечение, образцы сохранены в архиве. Ваш врач может их запросить.

Где проводится это исследование?

Все исследования проводятся в лаборатории Caris, которая находится в Фениксе, Аризона, США. Все лаборатории сертифицированы, работают только лицензированные техники, ученые, патологи и врачи.

Когда я смогу получить результаты исследования?

В среднем от момента получения образца до подготовки отчета по результатам проходит 10–15 дней. Результаты тут же отправляются вашему врачу для обсуждения дальнейшей стратегии.

Рак — это заболевание, вызванное генетической мутацией или эпигенетическими модификациями на уровне транскрипции. Диагностика заболеваний на ранней стадии — это сложный шаг, который необходимо предпринять для улучшения результатов выживания пациентов. Последние успехи возродили интерес и закончились разработкой различных потенциальных биомаркеров. Биомаркеры рака включают ДНК, РНК, белки, липиды, сахара, мелкие метаболиты, цитокинетические и цитогенетические параметры и все опухолевые клетки, обнаруженные в различных жидкостях организма. Биомаркеры должны быть тщательно исследованы для точной диагностики болезни и для помощи в разработке таргетной терапии для улучшения результатов заболевания.

Эпигенетика достаточно молодая наука, которая изучает изменения в экспрессии генов или фенотипа клеток, вызванных механизмами, не затрагивающими последовательность ДНК.

Метилирование ДНК и модификации гистонов считаются основными эпигенетическими механизмами 1. Они играют жизненно важную роль в таких процессах как репликация, транскрипция и восстановление ДНК. Следовательно, изменения генома или аномальная экспрессия различных регуляторов могут вызывать выраженный эффект, приводящий к индукции рака [6,7].

В генах, которые ингибируют развитие опухолевых образований, есть зона промотора с CpG-островками. Гиперметилирование таких островков является важным механизмом инактивации генов. Гипометилирование способствует росту различных типов злокачественных новообразований 9.

Метилирование ДНК связано со многими ключевыми процессами, такими как инактивация теломер, центромер, Х-хромосом и подавление повторяющихся элементов, геномный импринтинг и канцерогенез. Существует два типа аномального метилирования ДНК, связанного со злокачественными новообразованиями человека. Глобальное гипометилирование часто связано с нестабильностью хромосом и потерей импринтинга, тогда как гиперметилирование происходит на островках CpG, расположенных в зонах промотора, и часто связано с инактивацией генов-супрессоров опухолей 19.

Эпигенетические аберрации оказывают влияние на стадии развития опухоли, что в конечном итоге способствует росту и дифференцировки опухолевых клеток. Определение этих изменений может быть использовано в качестве прогностических биомаркеров для диагностики рака в начале заболевания. Эти биомаркеры будут полезны для выявления пациентов, злокачественные новообразования которых чувствительны к препаратам. Кроме того, они могли бы дать гарантию того, что у пациентов будут положительные результаты от новых средств, нацеленных на онкогены 24.

Открытие новых биомаркеров является сложным шагом в исследовании рака. Биомаркер – это биологический объект, обнаруженный в тканях, крови или других биологических жидкостях, который указывает на нормальное или ненормальное течение заболевания 33. Разработаны различные типы биомаркеров рака для скрининга пациентов, находящихся в группе риска, или для обнаружения определенного типа рака или для прогнозирования результатов лечения опухоли или для подбора специфической лекарственной терапии 35.

Биомаркеры в основном подразделяются на три категории. Диагностические и прогностические биомаркеры относятся к количественным признакам, которые помогают врачам лучше всего подобрать терапию. Эти биомаркеры существуют в различных формах; биомаркеры включают в себя оценку пациентов с помощью радиологических методов и использование опухолеспецифических антигенов. Высокоэффективное секвенирование ДНК, масс-спектрометрия и ДНК-микролинейка — прогресс в технологиях изучения генома человека. Все это привело к развитию биомаркеров, связанных с выявлением рака, путем сравнения последовательности и уровня экспрессии ДНК, РНК и белка. Генетические и геномные методологии, например, исследование картины экспрессии генов, полученной с помощью технологии ДНК-микролинейки, играют важную роль в диагностике и прогнозировании рака и многих других заболеваний 60.

Онкология — это группа заболеваний, которая включает генетические модификации, такие как точечные мутации, генные перестройки и амплификации генов, приводящие к изменениям в молекулярных путях, регулирующих рост клеток, выживание и метастазирование 67. Когда эти типы изменений появляются среди большого числа пациентов, имеющих определенный тип опухоли, то такие изменения могут быть использованы в качестве биомаркеров для определения терапии [71,72].

Биомаркеры, основанные на антигенах.

Опухоль выделяет небольшое количество макромолекул во внеклеточную жидкость, из которой некоторые белки попадают в кровоток и сохраняются там некоторое время. Они выделяются из сыворотки и работают в качестве потенциальных биомаркеров [73, 74].

Простат-специфический антиген (ПСА)

Простат-специфический антиген (ПСА), вероятно, является наиболее широко распространенным биомаркером при диагностике рака предстательной железы. Он относится к семейству генов Калликреин и продуцируется как нормальными, так и злокачественными эпителиальными клетками предстательной железы. ПСА находится в небольших количествах в сыворотке нормальных мужчин и повышается при раке предстательной железы 79.

Альфа-фетопротеин (АФП) — это известный диагностический биомаркер, используемый при диагностике гепатоцеллюлярной карциномы (ГЦК). Но он не является специфическим для выявления ранних стадий гепатоцеллюлярной карциномы. Это основной сывороточный фетальный белок, обнаруженный у млекопитающих. Он активно продуцируется и секретируется гепатоцитами. В связи с тем, что уровни АФП могут повышаться в сыворотке у пациентов с другими хроническими заболеваниями печени; АФП не может использоваться для скрининга у пациентов, страдающих гепатитом C или циррозом [80,81].

Антиген рака-125 (CA125)

CA-125 антиген, как известно, является основным маркером в сыворотке крови, используемым для диагностики рака яичников, для прогноза, ответа на химиотерапию и прогрессирование болезни. Антиген CA 125 является мембранным гликопротеином, который находится в целомическом эпителии и экспрессируется большинством видов эпителиального рака яичников. Основным недостатком использования маркера CA125 в качестве инструмента для скрининга является его низкая чувствительность и эффективность при диагностике ранних стадий онкопроцесса. Он также может быть повышен при других злокачественных новообразованиях, в том числе при раке легких, раке фаллопиевых труб, раке молочных желез, раке эндометрия и желудочно-кишечного тракта 83.

Тироглобулин (Tg) является органо-специфическим опухолевым маркером; связанным с пациентами, имеющими дифференцированный рак щитовидной железы, источник которого фолликулярные клетки. При раке щитовидной железы уровень тиреоглобулина в крови нарастает. Он считается гликопротеином большого размера, хранящимся в коллоиде фолликулов щитовидной железы, который действует как прогормон в синтезе тироксина (Т4) и трийодтиронина (Т3) в щитовидной железе 89.

Белок теплового шока (Hsp)

Белок теплового шока (Hsp) приобрел значение из-за влияния на прогрессирование опухоли и ответа на лечение. Это привело к развитию таргетной терапии путем использования Hsp в качестве иммунологического адъюванта в противораковых вакцинах. Экспрессия белков теплового шока (Hsp) усиливается при различных раковых заболеваниях. Кроме того, они участвуют в процессах, связанных с клеточным циклом. Обычно патологические процессы связаны со стимуляцией индуцирования Hsp физиопатологическими особенностями микроокружения опухоли 92.

Хорионический гонадотропин человека (hCG)

Хорионический гонадотропин человека (hCG) является гормоном, в норме продуцируемым плацентой. Кроме того, его концентрация повышается в крови пациентов с определенными видами рака яичников, яичек и хориокарциномой. Повышение уровня ХГЧ и его метаболитов в сыворотке нельзя рассматривать в качестве прогностического маркера, поскольку, по результатам исследований, βhCG может непосредственно изменять рост опухоли, что приводит к худшему результату. У беременных уровень ХГЧ всегда повышен, поэтому при данном состоянии он не может быть использован в качестве маркера онкологии 99.

Цитотоксическая химиотерапия и лучевая терапия считаются лучшими методами, доступными для лечения злокачественных новообразований. Однако они могут вызывать серьезные побочные эффекты, такие как повреждение нормальных клеток вместе с опухолевыми клетками. Недавние достижения в понимании основного механизма развития рака привели к развитию таргетных методов лечения, которые могут ингибировать рост опухолевых клеток, мешающих молекулярным путям, ведущим к апоптозу. Например, препараты Иматиниб и Эрлотиниб могут ингибировать активность тирозинкиназы белка, нацеленной на рецепторы эпидермального фактора роста (EGFR). Другие таргетные препараты, такие как антитела бевацизумаб, будут действовать на фактор роста, который стимулирует рост опухолевого кровеносного сосуда 105.

Большинство злокачественных опухолей зависят от глюкозы, необходимой для их развития. Когда изучали корреляцию различных видов опухолей человека с разной степенью гликолиза, было обнаружено, что существует обратная зависимость между скоростью гликолиза и повреждением, вызванным химиотерапевтическими лекарственными средствами и излучением. Исследования показали, что 2-DG избирательно сенсибилизирует опухолевые клетки к ионизирующей радиации, не вызывая повреждения нормальных клеток. Таким образом, клинические испытания у пациентов с опухолями головного мозга при использовании протокола гипофракционной радиотерапии в сочетании с 2-DG оказались успешными. Комбинированная терапия привела к минимальной острой токсичности и поздним радиационным эффектам, также было отмечено значительное увеличение выживаемости и улучшение качества жизни 108.

Мишень рапамицина в клетках млекопитающих (mTOR)

Мишень рапамицина в клетках млекопитающих (mTOR) – это серин-треониновая протеинкиназа, которая является членом семейства PIKK [фосфатидилинозитол-3-киназа-подобная киназа (PI3K)], представляет собой важную часть в регулировании развития и пролиферации клеток. Когда mTOR активируется, повышаются уровни фосфорилирования его мишеней p70S6K и 4EBP1, что приводит к увеличению уровней биогенеза рибосом, трансляции, ингибированию аутофагии и реорганизации актинового цитоскелета. Исследования показали, что сигнальный путь (PI(3)K) -PTEN-mTOR аберрантно активируется во многих опухолях, что приводит к дисрегуляции клеточного роста и пролиферации. Потеря мРНК PTEN или производство белка в опухолевой ткани могут рассматриваться как биомаркеры для оценки активации молекулярного пути. Маркер пролиферации Ki-67 используется для оценки ингибирования mTOR рапамицином, который может показывать присутствие фосфорилированной формы рибосомального белка S6 и его терапевтическое действие на опухолевые клетки 112

Теломераза представляет собой фермент, известный как обратная транскриптаза, которая использует РНК в качестве матрицы для продуцирования ДНК и содержит как РНК, так и белковые компоненты. Фермент является единственным ответственным за защиту клетки от деградации и смерти путем поддержания теломер. Таким образом, его можно рассматривать как один из лучших диагностических маркеров рака человека, что делает его идеальной мишенью для химиотерапии 116.

Известно, что ген р53 является геном-супрессором опухоли, который предотвращает неконтролируемое деление аномальных клеток. Радиация и многие другие противоопухолевые препараты вызывают повреждение ДНК раковых клеток, которое активирует ген р53, что приводит к апоптозу. Во время лечения, интактный ген p53 дикого типа, по существу, необходим для стимуляции запрограммированной гибели раковых клеток. Таким образом, ген p53 является хорошо изученным потенциальным биомаркером для прогнозирования и ответа пациента на терапию [120, 121].

Тирозинкиназа относится к группе ферментов, которые регулируют различные клеточные процессы, такие как рост клеток, дифференцировка, миграция и апоптоз, которые способствуют развитию опухолей и их прогрессированию. Таким образом, влияние на белок тирозинкиназы как на терапевтический биомаркер является привлекательным подходом к остановке роста опухоли. Например, ингибиторы тирозинкиназы Гефитиниб и Трастузумаб оказались противораковыми средствами 123.

Клетки как биомаркеры

Циркулирующие опухолевые клетки (CTCs)

Циркулирующие опухолевые клетки можно рассматривать как мощные биомаркеры для прогноза прогрессирования заболевания и реакции на терапию. Увеличение CTCs в любой момент во время терапии является показателем прогрессирования, тогда как снижение количества CTCs показывает эффективность терапии. Исследования показали, что их можно рассматривать как стандартные маркеры опухолей (например, Ca27-29) при оценке прогноза заболевания [124].

Т-регуляторные клетки (CD4 +, CD25 + и Foxp3 +)

T-регуляторные клетки (T-regs) считаются важными в индуцировании и поддержании периферической аутотолерантности, что препятствует развитию иммунной патологии. Предполагается, что они контролируют как естественные, так и приобретенные иммунные ответы. T-regs хорошо известен как суррогатный иммунный маркер прогрессирования рака; также выступает в качестве предиктора ответа на таргетные методы лечения. Наличие клеток FoxP3 + в опухолях помогает в оценке прогноза, метастатической способности и инвазивности некоторых опухолей путем модуляции способности иммунной системы нацеливаться на опухолевые клетки 125.

Стволовые клетки (CSC).

Раковые стволовые клетки являются субпопуляцией клеток, которые обладают способностью к самообновлению и генерации более дифференцированного потомства, составляющего основную массу опухоли. Исследования показали, что раковые стволовые клетки (CSC), опухолеобразующие клетки или клетки, инициирующие опухоль, могут приводить к появлению новых опухолей при трансплантации их животным с иммунодефицитом. Поэтому крайне важно идентифицировать CSC для каждой возможной опухоли, что может привести к новым методам лечения 130.

Эпигенетические изменения были связаны с развитием и прогрессированием рака у человека. Исследования показали, что эпигенетические модификации являются обратимыми, в отличие от генетических мутаций. Это заставило исследователей сосредоточиться на разработке эпигенетических препаратов для лечения больных раком. Хотя исследования в области эпигенетики привели к улучшению результатов лечения пациентов с определенными формами лимфомы и лейкемии с использованием препаратов, которые изменяют метилирование ДНК и ацетилирование гистонов, следует уделять больше внимания оптимизации и подтверждению маркеров метилирования в клинических испытаниях. Терапия, направленная на отмену эпигенетических изменений в раковых клетках, а также диагностические и прогностические анализы, основанные на моделях метилирования генов, являются многообещающими направлениями для будущего прогресса в лечении пациентов.

Journal of Oncology Research and Treatment.

J Oncol Res Treat, Vol 2(1).

Epigenetics — Role as Biomarker in Cancer Diagnosis.

Manasa P* Department of Biotechnology, JNTU Hyderabad, India.

В трудных случаях, когда гистологический тип опухоли не идентифицирован или когда стандарты лечения не определены либо исчерпаны, появляется необходимость определить, к каким же химиопрепаратам чувствительна опухоль. Чаще всего этот анализ используется для пациентов, которым стандартная терапия по общепринятым протоколам уже проводилась, но оказалась неэффективной. Анализ на определение чувствительности к химиопрепаратам относится к разновидности молекулярно-генетического исследования.

Современная онкология дала возможность определять чувствительность опухоли к химиопрепаратам. Проводимое исследование выявляет особенные клеточные компоненты, наличие которых и определяет, есть чувствительность к какому-либо химиопрепарату или нет. Эти клеточные компоненты часто называют биомаркерами.

После проведенного исследования на чувствительность к химиопрепаратам выдается заключение, в котором указаны найденные биомаркеры. По их количеству можно определить, к каким группам химиотерапевтических препаратов чувствительна данная опухоль, а какие препараты не смогут обеспечить необходимого лечебного эффекта.

    Данные анализа на чувствительность к химиопрепаратам помогут лечащему онкологу найти наиболее эффективный цитостатик, который даст максимальный результат от лечения и обеспечит благоприятный исход заболевания. Именно после этого исследования онколог сможет назначить оптимальный протокол лечения, который подходит именно вам, исходя из данных о чувствительности вашей опухоли и общего состояния организма.

Также, определение чувствительности к химиопрепаратам поможет выбратьтерапию, которая обычно не применяется при определенном виде заболевания, но может иметь положительный эффект, исходя из конкретной чувствительности вашей опухоли.

Результат этого анализа позволит получить данные, которые помогут попасть на участие в клиническом исследовании новых препаратов лечения того или иного заболевания.




Для каких опухолей возможно проведение анализа на чувствительность к химиопрепаратам?

При проведении анализа на чувствительность к химиопрепаратам используются технологии, включающие в себя иммуногистохимический анализ, флуоресцентную гибридизацию in situ, хромогенную гибридизацию in situ и секвенирование.

Для чувствительности к различным группам цитостатических препаратов определяют различные биомаркеры в опухолевой клетке:

    Чувствительность к Антрациклинам определяет высокий уровень Топоизомеров 2а.

К группе Таксанов будет чувствительна та опухоль, в которой наименьшее количество биомеркера B-тубулин 3. Наличие в опухолевых клетках биомаркера ЦиклинD1 говорит, наоборот, о нечувствительности опухоли к Таксанам.

Для чувствительности к фторпиримидинам определяют уровень ТР, ТS, MSH2.

Если при колоректальном раке невозможно определить наличие мутаций KRAS, определяют наличие Pten белка - если он присутствует в опухолевой клетке, то анализ на мутацию KRAS также будет положительный, и наоборот.

Опухоль, чувствительная к препаратам платины, будет иметь биомаркер ERCC-1. При трижды-негативном раке молочной железы также проводят анализ на наличие мутации BRCА1. Если она присутствует, то пациентке назначаются препараты платины.

  • При немелкоклеточном раке легкого определяют наличие экспрессии биомаркеров Рl и TTF1. Рак легкого с наличием этим биомаркеров - более чувствительный к химиотерапии с использованием Пеметрекседа, а TTF1-негативный – к комбинации Паклитаксел + Карбоплатин.
    • При ALK-позитивном раке легкого определяют биомаркер ROS1. Если биомаркер присутствует в опухоли, она более чувствительна к режиму Пеметрексед+Цисплатин, чем к лечению Кризотинибом.
    • Анализ уровня экспрессии генов UGT1A1- позволит определить чувствительность опухоли кишечника, к препарату Иринотекан.

    Анализ на определение чувствительности к химиопрепаратам, зачастую проводится вместе с молекулярно-генетическим исследованием опухоли.


    Иммунная система способна распознавать опухолевые клетки, однако и опухоль может влиять на иммунные клетки, затормаживания одни и стимулируя другие. Применение блокаторов иммунологических контрольных точек (ИКТ, англ. immunological checkpoints) в лечении опухолевых заболеваний позволяет снять ограничения, поставленные опухолевыми клетками на иммунную систему. Эффективность такой терапии зависит от типов иммунных клеток, присутствующих в опухоли. Традиционно большое внимание уделяется цитотоксичным Т-клеткам и их поверхностным белкам. Другие иммунные клетки также могут способствовать лечению опухоли, однако их роль при использовании блокаторов ИКТ недостаточно изучена.

    На прошлой неделе Nature опубликовал сразу три статьи, показывающие, что пациенты, в чьих опухолях В-клетки входят в состав третичных лимфоидных структур (TLS), лучше отвечают на лечение блокаторами ИКТ.

    Клетки иммунной системы в опухоли и ее микроокружении образуют агрегаты — третичные лимфоидные структуры (они напоминают лимфоузлы, но не имеют капсулы). Возникло предположение, что В-клетки в слабо структурированных, незрелых TLS вырабатывают факторы, ингибирующие иммунный ответ, и такое строение TLS ассоциировано с низкой активностью Т-клеток в опухоли. В зрелых же и хорошо структурированных TLS В-клетки, собранные в сердцевине клеточного агрегата, активно высвобождают противоопухолевые антитела, презентируют опухолевые антигены Т-клеткам, активируя их.

    Группа под руководством исследователей из Техасского университета провела секвенирование опухолевой РНК пациентов со злокачественной меланомой, которые участвовали в клиническом исследовании неоадъювантной (то есть первичной, применяемой до хирургического вмешательства) иммунотерапии контрольных точек. Оказалось, что успех терапии положительно зависит от экспрессии В-клеточных генов, вне зависимости от присутствия других иммунных клеток: у пациентов с хорошим ответом на терапию она была повышена. Аналогичный результат дало профилирование белков с помощью GeoMx . Он подтвердился на двух дополнительных группах данных (пациенты с меланомой и раком почки, проходившие ИКТ). Иммуногистохимический анализ также показал, что у пациентов с благоприятным исходом В-клетки находятся внутри третичных лимфоидных структур. Плотность В- клеток и TLS в опухоли была выше у респондентов.

    Аналогичные результаты получили авторы двух других исследований. Одна группа изучала людей с метастатической меланомой, другая — с саркомой. Обе команды показали, что присутствие В-клеток в TLS опухоли перед началом лечения ассоциировано с более высоким шансом ответа на терапию.

    Helmink, B.A., et al. // B cells and tertiary lymphoid structures promote immunotherapy response. // Nature, 2020; DOI: 10.1038/s41586-019-1922-8

    Cabrita, R., et al. // Tertiary lymphoid structures improve immunotherapy and survival in melanoma. // Nature, 2020; DOI: 10.1038/s41586-019-1914-8

    Petitprez, F., et al. // B cells are associated with survival and immunotherapy response in sarcoma. // Nature, 2020; DOI: 10.1038/s41586-019-1906-8

    Цитата по пресс-релизу Онкологического центра М.Д. Андерсена

    Читайте также: